Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb11Q9QY30 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb11Q9QY30 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb11Q9QY30 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms