Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnip3Q9QXT8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip3Q9QXT8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms