Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChmQ9QXG2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChmQ9QXG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChmQ9QXG2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms