Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn12Q9ET43 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms