Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ropn1lQ9EQ00 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ropn1lQ9EQ00 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms