Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnft1Q9DCN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnft1Q9DCN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms