Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms