Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc2Q9CQP2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc2Q9CQP2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms