Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd3Q99MJ6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms