Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smc1bQ920F6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc1bQ920F6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms