Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx18Q91ZR2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx18Q91ZR2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms