Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab29Q91YQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rab29Q91YQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rab29Q91YQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab29Q91YQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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