Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col26a1Q91VF6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col26a1Q91VF6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col26a1Q91VF6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col26a1Q91VF6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col26a1Q91VF6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col26a1Q91VF6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col26a1Q91VF6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms