Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhdc3Q8VEM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhdc3Q8VEM9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms