Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx19Q8R1Q0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx19Q8R1Q0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx19Q8R1Q0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms