Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl47Q8K2Y7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl47Q8K2Y7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl47Q8K2Y7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms