Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf31Q8CCF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms