Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx6Q8C7R7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx6Q8C7R7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx6Q8C7R7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx6Q8C7R7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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