Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L8

Cog5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog5Q8C0L8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cog5Q8C0L8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog5Q8C0L8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog5Q8C0L8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog5Q8C0L8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms