Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2eQ80UW8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2eQ80UW8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2eQ80UW8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms