Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Gm20809Q62458 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20809Q62458 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20809Q62458 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20809Q62458 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Gm20809Q62458 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20809Q62458 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20809Q62458 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Gm20809Q62458 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gm20809Q62458 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gm20809Q62458 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Gm20809Q62458 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Gm20809Q62458 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20809Q62458 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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