Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TrhQ62361 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TrhQ62361 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TrhQ62361 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TrhQ62361 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TrhQ62361 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrhQ62361 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TrhQ62361 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TrhQ62361 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TrhQ62361 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms