Protein–RNA interactions for Protein: Q61312

Tfap2c, Transcription factor AP-2 gamma, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2cQ61312 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2cQ61312 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2cQ61312 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2cQ61312 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms