Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata6Q61169 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata6Q61169 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms