Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd5Q5VCS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd5Q5VCS6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms