Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms