Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znrf3Q5SSZ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znrf3Q5SSZ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms