Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trav2Q5R1I9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trav2Q5R1I9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trav2Q5R1I9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms