Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav3-3Q5R1C3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav3-3Q5R1C3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-3Q5R1C3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms