Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Herc2Q4U2R1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Herc2Q4U2R1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Herc2Q4U2R1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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