Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfyve27Q3TXX3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms