Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 RRP9YPR137W 1722 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 HSP150YJL159W 1242 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YMR295CYMR295C 594 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 MRPL10YNL284C 969 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YNL285WYNL285W 372 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 ATG4YNL223W 1485 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 NSE5YML023C 1671 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 SNU71YGR013W 1863 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 RAD3YER171W 2337 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 QNS1YHR074W 2145 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 DUG1YFR044C 1446 nt5.74□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 PAT1YCR077C 2391 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 CDC16YKL022C 2523 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YHL018WYHL018W 363 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 RPN7YPR108W 1290 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YBR226CYBR226C 411 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 TEL2YGR099W 2067 nt5.73□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 MSS1YMR023C 1581 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 HAP3YBL021C 435 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 ATP4YPL078C 735 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 GAT1YFL021W 1533 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 ALD6YPL061W 1503 nt5.72□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 MCM3YEL032W 2916 nt5.71□□□□□ -1.49
RPN6Q12377 YDL218WYDL218W 954 nt5.71□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 RPL10YLR075W 666 nt5.71□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 JNM1YMR294W 1122 nt5.71□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 LSG1YGL099W 1923 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 XBP1YIL101C 1944 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 DSF1YEL070W 1509 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YNR073CYNR073C 1509 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 RAD24YER173W 1980 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 HAP2YGL237C 798 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YJU3YKL094W 942 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 TAL1YLR354C 1008 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YML018CYML018C 1182 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YTH1YPR107C 627 nt5.7□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 KEX2YNL238W 2445 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YPL136WYPL136W 369 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YBR124WYBR124W 360 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 IRS4YKR019C 1848 nt5.69□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 GPB2YAL056W 2643 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 HIR1YBL008W 2523 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 RME1YGR044C 903 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 PHB1YGR132C 864 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 PYC1YGL062W 3537 nt5.68□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YPK2YMR104C 2034 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YLR463CYLR463C 552 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 CWC27YPL064C 906 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 HSP78YDR258C 2436 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 IMA2YOL157C 1770 nt5.67□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 STE13YOR219C 2796 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 TKL1YPR074C 2043 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YDL129WYDL129W 876 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 RPS5YJR123W 678 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YNL017CYNL017C 339 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 FSF1YOR271C 984 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 MCM6YGL201C 3054 nt5.66□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 CLB1YGR108W 1416 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 UTP4YDR324C 2331 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 RRP46YGR095C 672 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 LEU5YHR002W 1074 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 QRI5YLR204W 336 nt5.65□□□□□ -1.5
RPN6Q12377 KDX1YKL161C 1302 nt5.65□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 CRZ1YNL027W 2037 nt5.65□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 ERC1YHR032W 1746 nt5.65□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 JIP4YDR475C 2631 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 FAT3YKL187C 2253 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 GIT1YCR098C 1557 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 YER186CYER186C 921 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 RPS2YGL123W 765 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 SCO2YBR024W 906 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 DIA3YDL024C 1407 nt5.64□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 PUS5YLR165C 765 nt5.63□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 RNH201YNL072W 924 nt5.63□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 MRP51YPL118W 1035 nt5.63□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 GUA1YMR217W 1578 nt5.63□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 TIM22YDL217C 624 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 DOT5YIL010W 648 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 DJP1YIR004W 1299 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 SRY1YKL218C 981 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 STM1YLR150W 822 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 YOL131WYOL131W 327 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 ASN1YPR145W 1719 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 GPT2YKR067W 2232 nt5.62□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 GPA2YER020W 1350 nt5.61□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 YEH1YLL012W 1722 nt5.61□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.61□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 ATP1YBL099W 1638 nt5.61□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 MKK2YPL140C 1521 nt5.61□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 YDR109CYDR109C 2148 nt5.6□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 GEX1YCL073C 1848 nt5.6□□□□□ -1.51
RPN6Q12377 GEX2YKR106W 1848 nt5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms