Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calb2Q08331 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb2Q08331 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb2Q08331 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms