Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdx4Q07424 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms