Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcn1Q05186 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcn1Q05186 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcn1Q05186 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms