Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx3P81067 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx3P81067 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx3P81067 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irx3P81067 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx3P81067 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx3P81067 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx3P81067 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx3P81067 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx3P81067 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms