Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb6P70689 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb6P70689 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb6P70689 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms