Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PctpP53808 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PctpP53808 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PctpP53808 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PctpP53808 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PctpP53808 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PctpP53808 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PctpP53808 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PctpP53808 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PctpP53808 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PctpP53808 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PctpP53808 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PctpP53808 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PctpP53808 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PctpP53808 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PctpP53808 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PctpP53808 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PctpP53808 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PctpP53808 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PctpP53808 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PctpP53808 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PctpP53808 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PctpP53808 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PctpP53808 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PctpP53808 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PctpP53808 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PctpP53808 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PctpP53808 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PctpP53808 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PctpP53808 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PctpP53808 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PctpP53808 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PctpP53808 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PctpP53808 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PctpP53808 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PctpP53808 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PctpP53808 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PctpP53808 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PctpP53808 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PctpP53808 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PctpP53808 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms