Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdkn1cP49919 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkn1cP49919 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn1cP49919 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms