Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbx1P41778 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms