Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xrcc6P23475 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrcc6P23475 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrcc6P23475 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms