Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edn1P22387 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edn1P22387 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edn1P22387 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edn1P22387 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms