Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rag1P15919 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rag1P15919 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rag1P15919 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rag1P15919 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rag1P15919 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rag1P15919 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rag1P15919 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rag1P15919 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms