Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myf6P15375 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myf6P15375 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myf6P15375 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myf6P15375 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Myf6P15375 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms