Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa7P02830 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hoxa7P02830 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa7P02830 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms