Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtatp6P00848 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp6P00848 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms