Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp8O89110 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp8O89110 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp8O89110 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Casp8O89110 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp8O89110 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp8O89110 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp8O89110 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms