Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl20O89093 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ccl20O89093 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl20O89093 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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