Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf5O70191 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf5O70191 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf5O70191 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf5O70191 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf5O70191 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf5O70191 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atf5O70191 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atf5O70191 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atf5O70191 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atf5O70191 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf5O70191 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Atf5O70191 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf5O70191 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf5O70191 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf5O70191 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf5O70191 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atf5O70191 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf5O70191 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atf5O70191 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf5O70191 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf5O70191 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf5O70191 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf5O70191 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms