Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kif1cO35071 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kif1cO35071 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif1cO35071 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif1cO35071 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif1cO35071 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms