Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm16427J3QN52 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16427J3QN52 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16427J3QN52 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms